人生就是博-尊龙凯时 发布了一篇关于胃癌进展的研究，题目为《肠道化生的时空基因组分析揭示了胃癌进展中的克隆动态》，该研究于2023年12月在《癌细胞》杂志上发表，影响因子为5.03。本研究利用了单细胞测序、GeoMx DSP、全外显子测序（WES）和批量RNA测序等实验平台，并基于定制的胃癌基因面板（包括277个基因，来源于TCGA及其他研究中涉及的突变基因）进行分析。

样本信息

• 患者信息：研究包含2980名年龄在50岁及以上的中国患者。
• 时间跨度：2004年至2015年。
• 取样区域：涵盖了多个胃的区域，包括幽门、胃体及贲门。

单细胞空间组学的应用

人生就是博-尊龙凯时 的研究首先通过对10名非癌症受试者的单细胞RNA测序（scRNA-seq）鉴定出四类主要细胞群，分别为胃细胞群、肠道细胞群、免疫细胞群及基质细胞群。重点对胃和肠的谱系进行了细分注释，确认了两种胃细胞和四种肠细胞。细胞比例分析显示，肠道细胞和胃细胞的比例减少与肠道化生（IM）严重程度密切相关。研究中发现，SOX9基因在特定细胞类型（如胃LYZ+细胞和肠道干细胞）中的表达水平显著升高。

再者，GeoMx DSP技术被应用于对8例胃癌患者的组织切片进行分析，并结合前述的scRNA-seq数据来确定细胞类型在空间上的分布。根据不同的IM区域，研究将其标记为“干细胞显性”或“肠细胞显性”。富集分析结果显示，干细胞显性IM区域的氧化磷酸化基因集显著过表达，并在胃癌区域中亦有显著表达。进一步的分层聚类分析显示，干细胞显性IM与癌细胞群共享相似的表达特征，而肠细胞主导的IM则表现出与胃癌的明显异质性，表明在同一患者体内，IM的表现存在显著差异。

研究总结

本研究通过结合单细胞空间数据分析，确定了肠道细胞和胃细胞在肠道化生严重程度方面的关联性，同时揭示了干细胞显性IM与恶性细胞群体之间的相似表达特征。值得注意的是，SOX9在某些特定细胞类型中表现出显著的高表达，进一步推动了我们对胃癌进展机制的理解。